Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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