Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Snx20Q9D2Y5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms