Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pramef12Q9D2F1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms