Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Spns3Q9D232 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Spns3Q9D232 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Spns3Q9D232 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Spns3Q9D232 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Spns3Q9D232 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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