Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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