Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Khdc3Q9CWU5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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