Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ddx28Q9CWT6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ddx28Q9CWT6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ddx28Q9CWT6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ddx28Q9CWT6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ddx28Q9CWT6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ddx28Q9CWT6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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