Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hdac9Q99N13 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hdac9Q99N13 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms