Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ciao1Q99KN2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ciao1Q99KN2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ciao1Q99KN2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ciao1Q99KN2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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