Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp11Q99K46 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms