Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms