Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ubxn4Q8VCH8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms