Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms