Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cnot3Q8K0V4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnot3Q8K0V4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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