Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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