Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms