Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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