Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms