Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snx17Q8BVL3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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