Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms