Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shq1Q7TMX5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms