Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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