Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssx9Q6XAS3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssx9Q6XAS3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssx9Q6XAS3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssx9Q6XAS3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssx9Q6XAS3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssx9Q6XAS3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ssx9Q6XAS3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms