Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smchd1Q6P5D8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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