Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pkp4Q68FH0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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