Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sall3Q62255 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms