Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms