Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms