Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Urb1Q571H0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms