Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zmat1Q3V0C1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms