Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Fchsd2Q3USJ8 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Fchsd2Q3USJ8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Fchsd2Q3USJ8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fchsd2Q3USJ8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms