Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm28047Q3US59 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28047Q3US59 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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