Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms