Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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