Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cops9Q3U898 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cops9Q3U898 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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