Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Q3U6N9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Q3U6N9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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