Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Hvcn1Q3U2S8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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Hvcn1Q3U2S8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Hvcn1Q3U2S8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Hvcn1Q3U2S8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Hvcn1Q3U2S8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hvcn1Q3U2S8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms