Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ccndbp1Q3TVC7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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