Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax1Q2NKI2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms