Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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