Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Itgb8Q0VBD0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb8Q0VBD0 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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