Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn2bQ0KL01 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms