Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NeblQ0II04 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms