Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc21bQ0HA38 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms