Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc4Q08624 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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