Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms