Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms