Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sec23aQ01405 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sec23aQ01405 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec23aQ01405 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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