Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
F8a1Q00558 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms