Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AlkP97793 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AlkP97793 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AlkP97793 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AlkP97793 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AlkP97793 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms